Utilisateur:Michel Chauvet/Brouillon recommandations taxobox

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Titre proposé pour la taxobox : Classification scientifique

Commentaire. Les classifications ne cessent d'évoluer. Il est recommandé d'utiliser les classifications les plus récentes faisant l'objet d'un consensus. Par ailleurs, une expression générale comme Classification scientifique peut s'appliquer à tous les être vivants.

Cette page pourrait être ajoutée à celle-ci : Projet:Botanique/Plan type espèces végétales.

Angiospermes[modifier | modifier le code]

Au niveau des familles, des ordres et des catégories supérieures, la classification utilisée aux débuts de Wikipédia était celle de Cronquist. Ensuite sont apparues APG, APG II, APG III, et maintenant APG IV.

La classification de l’Angiosperm Phylogeny Group est publiée, comme son nom l'indique, par un groupe représentatif de taxonomistes. Mais elle ne couvre que les Angiospermes, au niveau des familles, des ordres et des catégories supérieures.

Elle utilise une approche cladistique et intègre des arguments de diversité moléculaire. Peu de livres ont encore pu la suivre, ce qui fait qu'elle perturbera quelque peu ceux qui sont habitués aux anciennes classifications.

Boraginales[modifier | modifier le code]

En complément à APG IV, un Boraginales Working Group s'est créé pour établir une classification consensuelle du groupe. D'après eux (Luebert et al., 2016), l'ordre des Boraginales comprend les familles suivantes :

Fabaceae / Leguminosae[modifier | modifier le code]

Les Fabaceae ou Leguminosae ont classiquement été divisées en trois sous-familles :

  • Caesalpinioideae
  • Mimosoideae
  • Faboideae ou Papilionoideae.

Si les deux dernières sont monophylétiques, les Caesalpinioideae étaient largement polyphylétiques. Une nouvelle classification (LPWG, 2017) reconnaît 6 sous-familles :

  • Duparquetioideae (LPWG, stat. nov.) : 1 genre, 1 espèce
  • Cercidoideae (LPWG, stat. nov.) : 12 genres, ca. 335 espèces : par exemple Bauhinia, Cercis
  • Detarioideae Burmeist. : 84 genres, ca. 760 espèces : par exemple Tamarindus
  • Dialioideae (LPWG, stat. nov.) : 17 genres, ca. 85 espèces
  • Caesalpinioideae DC. (y compris le clade des mimosoïdes) : 148 genres, ca. 4400 espèces : par exemple Caesalpinia, Cassia, Ceratonia, Delonix, Leucaena, Senna plus les mimosoïdes.
  • Papilionoideae DC. : 503 genres, ca. 14,000 espèces


Si l'on veut maintenir la sous-famille des Mimosoideae, il faut créer au moins 6 à 8 sous-familles dans les Caesalpinioideae pour obtenir des clades, ce qui n'a pas encore été fait.

  • LPWG (Legume Phylogeny Working Group), 2017. A new subfamily classification of the Leguminosae based on a taxonomically comprehensive phylogeny. Taxon, 66 (1): 44–77. doi: 10.12705/661.3

Classification des genres[modifier | modifier le code]

Pour certains groupes (Boraginales…), il existe des articles récents qui donnent la liste de tous les genres reconnus au sein d'une famille ou d'un ordre.

A défaut, en ce qui concerne les genres, on peut utiliser la série de livres de Kubitzki, K. et al., The families and genera of vascular plants. Elle donne des clés et des descriptions complètes des genres. L'intérêt est en outre qu'elle comprend les Ptéridophytes et les Gymnospermes. système de Kubitzki.

Choix des espèces[modifier | modifier le code]

Les meilleures bases de données[modifier | modifier le code]

  • GRIN (Genetic Resources Information Network) est une excellente BD sur les plantes d'intérêt agronomique : nomenclature, noms et usages, biblio. La quasi totalité des noms a été revue par un spécialiste, la BD est constamment mise à jour, et inclut des commentaires sur le choix des noms. Le curateur sollicite les commentaires et répond rapidement.
  • BD des Plantes d'Afrique (CJB de Genève). Pour les plantes africaines. Le curateur sollicite les commentaires et répond rapidement.
  • Tela Botanica. Pour les plantes sauvages en France.
  • World Checklist of Selected Plant Families pilotée par le jardin botanique de Kew. Comme son nom l'indique, elle ne couvre qu'une partie des familles.
  • Tropicos. Créée par le Missouri Botanical Garden, cette base de données était au départ à usage interne des chercheurs de l'institution, et se concentrait surtout sur la flore du continent américain. Avec 1,2 millions de noms scientifiques, elle est devenue une source importante au niveau mondial.

Sites agrégateurs[modifier | modifier le code]

Ces sites ont pour objectif d'agréger des données en provenance de nombreux sites. Ils sont avant tout gérés par des informaticiens, avec peu ou pas d'apport scientifique. Celui-ci est assuré par les sites de départ.

  • The Plant List. Cette base résulte d'une collaboration entre le jardin botanique de Kew et le Missouri Botanical Garden. L'ambition est de compiler une liste de travail unique des noms des plantes du monde. Le travail de validation étant en cours, la liste distingue les noms acceptés, les synonymes reconnus et les noms "non-résolus" (unresolved). Comme elle résulte d'une compilation brute, la liste comporte encore de nombreuses erreurs et incohérences, qui témoignent de l'ampleur de la tâche à accomplir. Son avantage est de donner tous les noms publiés. A utiliser par défaut.
  • Catalogue of Life
  • Integrated Taxonomic Information System (ITIS)
  • Species 2000
  • Global Biodiversity Information Facility
  • Encyclopedia of Life
    • C'est un site agrégateur, qui reprend donc les données d'autres sites, y compris Wikipedia en anglais.

Gymnospermes[modifier | modifier le code]

Kubitzki par défaut

Ptéridophytes[modifier | modifier le code]

La base de référence pour les familles, genres et espèces est : Checklist of Ferns and Lycophytes of the World de Michael Hassler et Bernd Schmitt. Elle est compatible avec PPG I (2016), la 1ère classification phylogénétique des Ptéridophytes du Pteridophyte Phylogeny Group : A community‐derived classification for extant lycophytes and ferns, lire en ligne.

Bryophytes[modifier | modifier le code]

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Algues[modifier | modifier le code]

La référence pour les familles, genres et espèces est :

Champignons[modifier | modifier le code]

La référence pour les familles, genres et espèces est :

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