Comme les autres peptidyl prolyl isomérases, elle permet la transformation de certaines protéines de la forme trans à la forme cis, modulant leur activité[6].
Elle se lie à une glycoprotéine de 77 Kdaltons, appelée le CyCAP (« cyclophilin C associated protein », son mode d'action nécessitant cette liaison[7]. Elle active alors la fonction phagocytaire des macrophages[6] et diminue la réaction inflammatoire[8].
Elle intervient dans la dégradation de l'ADN et dans l'apoptose[9].
La liaison avec le CyCAP est inhibée par la cyclosporine A qui inactive l'action de la cyclophiline C[10].
↑Trahey M, Weissman IL, Cyclophilin C-associated protein: a normal secreted glycoprotein that down-modulates endotoxin and proinflammatory responses in vivo, Proc Natl Acad Sci USA, 1999;96:3006–3011